正史记载，马皇后前后生五子二女：长子懿文太子朱标，次子秦愍王朱樉，三子晋恭王朱，四子明成祖朱棣，五子周定王朱橚;以及二女宁国公主，四女安庆公主。

有的说，朱元璋那些嫡子一个也不是她生的，而是她的养子，她只生了两个女儿。

马皇后一共生了5个儿子，分别是：朱标、朱樉、朱棡、朱棣、朱橚。

1、朱标

(1355年10月10日—1392年5月17日)，安徽凤阳人，明太祖朱元璋长子(也是嫡长子)，母孝慈高皇后马氏，明惠宗朱允炆之父。

朱标于元至正十五年(1355年)九月出生在太平商人陈迪家中。朱元璋称吴王时便将其立为世子，随宋濂学习经传。自幼受到悉心教导，明太祖对他寄予厚望，多方培养。洪武元年(1368年)正月立为皇太子，正式确立他为接班人。

2、朱樉

(1356年12月3日—1395年4月9日)，濠州钟离(今安徽凤阳)人，明太祖朱元璋第二个儿子 ，懿文太子朱标同母弟，明成祖朱棣同母兄，母亲孝慈高皇后马皇后，《南京太常寺志》记载为李淑妃所生，明代九大攘夷塞王之一。

3、朱棡

(1358-1398年)濠州钟离(今安徽省凤阳县)人，明太祖朱元璋第三子，母孝慈高皇后马氏(马皇后)，《南京太常寺志》记载为李淑妃所生，九大攘夷塞王之一。洪武三年(1370年)四月封晋王，洪武十一年(1378年)就藩太原。

4、朱棣

明成祖朱棣(1360年5月2日-1424年8月12日)，明太祖第四子，明朝第三位皇帝，年号永乐，故后人称其为永乐帝、永乐大帝 等。

5、朱橚

(1361年—1425年)，安徽凤阳人。明朝宗室，医学家。明太祖朱元璋第五子，明成祖朱棣的胞弟，生母待考证(因与朱棣同母，且朱棣本身生母存疑，故其生母可能性有二。孝慈高皇后马氏或碽妃)。

根据《明史》记载，马皇后一生共生下了五个儿子和两个女儿。《明史》是二十四史的最后一部，也是公认其中最完善的一部。二十四史是历朝历代的最正统的史书，因此《明史》对马皇后子女数量的记载具有很高的可信度。

马皇后生了5个儿子，为什么朱元璋最喜欢朱标?

1、朱标作为朱元璋的长子，一般被认为是朱元璋与正妻马皇后的长子，即嫡长子，他备受朱皇帝的疼爱和重视。

在中国古代封建皇权传承中都遵循着嫡长子继承制，立嫡立长，而不立贤。举例来说，李世民之所以无法被立为太子，就是因为他不是嫡长子，他是嫡次子。而玄武门事变会爆发，李世民不得不以血腥的政变方式夺权，就是因为他不是太子。显然朱标在这方面有着得天独厚的优势(虽然有一小撮专家认为朱标并不是马皇后的儿子)，考虑到朱元璋和马皇后的感情，朱元璋对于朱标这个长子自然是喜爱。朱标自打出生后就被作为接班人来培养，朱元璋让他深入民间，探访疾苦，让他了解到创业的艰辛和百姓生活得不易，可以说得上是用心良苦了。

朱元璋出生贫苦，没有什么机会受教育，算是个文盲，之后在创业过程中一边打仗，一边学习，算是半工半读，自学成才。但他很重视对儿子的教育培养，尤其是对朱标，这个长子兼太子，未来帝国的继承者，可以说倾注了所有的心血，耗尽了光阴。为他请的老师都是当时饱学儒士，文化界的大V，朱标也没有辜负朱元璋的期望，他有着符合儒家标准的仁爱谦让，学识渊博，朱元璋很早就让朱标学习如何处理朝政，使朱标在拥有理论知识的基础上，不乏实际经验和教训。

2、朱标和朱元璋的性格互补，是朱元璋理想的接班人。

朱元璋以其独特的经历，他当过和尚，要过饭，然后投奔郭子兴的义军，经过奋斗，实现了屌丝的逆袭，从乞丐到皇帝的华丽转身，使他成为中国历史上最富有传奇色彩的皇帝。他在战争年代里锻造出的刚毅和杀伐决断使他在对待贪腐和如何对待功臣等重大政治问题上大开杀戒，雷厉风行。其强硬和决绝在中国历史上的皇帝里无人能出其右者。他杀人不是一个一个杀，一杀就是几万人，杀得是人人自危，朝不保夕。朱元璋施政太猛，严刑峻法虽然有利于巩固新生的大明政权，也有利于整肃和刷新吏治。但毕竟对于一个国家来说稳定才是大局，朱元璋并非不清楚这一点，朱标的仁爱和宽和是朱元璋所看重的，也是朱元璋其他儿子所不具备的。

但是朱元璋认为在危胁皇权的因素没有消除之前，朱标的仁爱就是软弱，就是妇人之仁。朱元璋认为危胁皇权的因素是什么?就是贪腐，就是骄兵悍将，那些居功自傲，为非作歹的功臣宿将。所以当朱标对朱元璋提出希望能够减少杀戮的时候，朱元璋才会那么生气。在他看来为君主者，不是不需要仁爱之心，仁爱之心适用于对平民百姓，但不适用于贪赃枉法的乱臣贼子，对于乱臣贼子就是要用雷霆手段，才能起到震慑作用。朱元璋希望自己当恶人，用自己沾满鲜血的双手，帮助朱标扫清障碍，让朱标的仁爱，宽和能够有用武之地。

朱元璋施政刚猛，是为了统治的需要，朱元璋希望朱标将来即位后以他仁爱实行仁政，也是为了统治的需要。朱标的仁爱，宽和也为朝野所瞩目，在经历朱元璋时代的恐怖和暴力之后，他们迫切需要一种宽厚和缓和的政治环境，无疑朱标是最合适的人选，他比朱元璋的任何一个儿子都要适合那个位置。

《明史》记载朱元璋前五个儿子懿文太子、秦愍王、晋恭王、明成祖、周定王都是马皇后所生。根据《明实录》明成祖生于1360年4月17日，周定王生于1361年7月9日。这种情况历来都被怀疑，特别是在混乱的年代，姬妾如云的环境中，岂能任由马皇后独自负担生育的任务，而且明人早就指出“或曰高皇后无子”[5]。其他明人说得比较婉转，或者给朱氏留一点面子。如潘柽章《国史考异》：“按今玉牒云：第四子今上，第五子周王，高后所生也。”郎瑛《七修类稿》：“高后生二子，出今鲁府玉牒。”《南京太常志》：“孝陵神位，左一位淑妃李氏，生懿文太子、秦愍王、晋恭王。右一位碽妃，生成祖文皇帝， 孙贵妃生周王。”朱彝尊《静志居诗话》卷十三沈元华条：“奉先庙制(南京太庙奉先殿)高后南面，诸妃尽东列，西序惟碽妃一人，具载南京太常寺志。善高后从未怀妊，岂惟长陵，即懿文太子亦非后生也。”李清《三垣笔记》：“南太常志载成祖为碽妃所生，讶之。钱宗伯谦益有博学名，问之，亦不能决，以志言东侧列妃嫔二十余，西侧止一碽妃。因启寝殿验之，入视果然，乃信。”刘继庄《广阳杂记》明成祖母为瓮氏，蒙古人，以其为元顺帝妃，故隐其事。“宫中别有庙藏神主，世世祀之，不关宗伯。有司礼监为彭躬庵言之，少时闻燕之故老为此说，今乃信也。”以上都是明人的记载。

也有说明成祖夺了侄子明惠帝的皇位，想更一步名正言顺(朱元璋相当重视嫡庶之分)，便托称为马皇后所出，这样以嫡子的身份继承为帝便不为过。